面向全球招收知识产权法学专业、知识产权管理专业博士（学制4年）。2015年起，博士招生采用“申请——考核制”，由研究院对符合报考条件的申请人进行考核，重点考察其专业基础、学术背景、科研经历及成果、外语水平、拟攻读博士学位的科学研究计划，侧重申请人的综合素质，学生奖学金优厚。此外，研究院于2014年起开设“知识产权台湾博士生专班”。